Ventriküler septal defektin tedavisi cerrahidir. Yenidoğan döneminde büyük çaplı VSD li hastalarda kalp yetmezliği tablosu geliştiğinden bir süre ameliyata hazırlık ve şikayeleri düzeltmek için ilaç tedavisi başlanır. Uygun şartlar sağlandıktan sonra hasta cerrahi tedaviye alınır. Ancak bazı hastalarda kasıktan girilen kateter ile şemsiye yöntemi sayesinde delik kapatılabilmektedir. Bu tedavi yöntemi belli şartlar gerektirmektedir ve her hasta için geçerli değerlidir. Ancak küçük çaplı VSD li hastalara belli ölçümler yapıldıktan sonra uygulanabilmektedir. Cerrahi işlemde hasta kalp akciğer makinasına bağlanmaktadır. Karıncıklar arasındaki defekt ise direkt dikiş, hastanın kendi kalp zarından hazırlanan yama yada sentetik yama ile kapatılmaktadır